داستان این قسمت بازی مربوط به شخصیت اصلی آن به نام Shay میشود. شی در ابتدای بازی در نقش یک اساسین ظاهر میشود. اساسینی که پدر خود را از داست داده و برای گرفتن انتقام خون پدرش، وارد انجمن برادری اساسینها شده است. اما طی حوادثی که در اوایل بازی مشاهده میکنیم، شی متوجه توطئهای از سوی دیگر اساسینه...
